Katzen und Hunde führen einen geheimen Krieg um die Gunst der Menschen.. Längst haben beide Rassen Geheimdienste ausgebildet, führen unterirdische Kommandozentralen und bedienen sich modernster Technik, um ihre Gegner auszuspionieren. Trotz ständiger Versuche beider Seiten, die Oberhand in diesem alten Konflikt zu gewinnen, konnte bis jetzt niemand das Patt überwinden.
Dies könnte sich allerdings ändern, wenn der verschrobene Wissenschaftler Dr. Brody (Jeff Goldblum) ein Serum entwickelt, das die Menschen von Hundehaarallergie heilt. Dies würde das Gleichgewicht kippen und den Hund endgültig als besten Freund des Menschen etablieren. Das können die Katzen nicht zulassen, weshalb sie versuchen, unter dem Kommando des Perserkaters Mr. Tinkles die Produktion des Heilmittels zu sabotieren.

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